Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 R -5 9 -4 -5 -7 -2 -3 -6 -3 -6 -5 0 -5 -6 -5 -4 -4 -6 -5 -6 0 97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 2.32 1.49 2 A 5 1 -4 -5 -4 -3 -4 -2 -5 -1 0 -3 -1 -3 -5 -1 4 -6 -5 -1 45 8 0 0 0 0 0 3 0 3 10 1 1 1 0 3 21 0 0 3 0.71 1.56 3 Q -2 -1 -2 -4 -6 3 -3 2 -5 -6 -5 2 -5 -2 5 1 2 -6 -5 -4 2 2 2 0 0 11 0 17 0 0 1 13 0 2 26 12 11 0 0 1 0.72 1.59 4 E -2 -2 1 -3 -6 6 4 -3 4 -6 -6 -2 -2 -4 -4 -1 2 -6 -3 -4 3 2 5 0 0 34 24 2 10 0 0 1 1 1 0 3 11 0 1 1 0.91 1.61 5 K -3 2 0 -4 -6 3 -3 -4 1 -2 -1 5 2 -2 -5 1 1 -4 -2 -3 1 10 3 0 0 12 0 1 3 2 7 30 4 2 0 12 10 0 1 1 0.54 1.61 6 V -3 -6 -6 -7 -5 -6 -6 -7 -6 3 4 -6 3 3 -4 -5 -4 -5 -3 5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 13 34 0 6 13 1 0 0 0 0 32 1.01 1.60 7 L -2 2 -4 -5 -2 -2 -4 -4 -2 -1 3 4 5 -2 -5 -1 1 -5 -4 -3 2 9 0 0 1 1 0 1 1 3 28 28 12 2 0 5 7 0 0 0 0.62 1.62 8 Q 0 0 -2 -4 -2 7 1 -4 2 -1 -3 -2 1 -5 -5 1 1 -5 -3 -1 7 5 1 0 1 43 7 1 4 4 2 1 3 0 0 8 8 0 1 5 0.77 1.62 9 K -1 2 0 -4 -6 0 0 -3 1 -5 -3 6 -2 -2 -5 -1 -1 -6 -5 -3 4 10 4 0 0 4 6 1 3 0 2 52 1 2 0 4 4 0 0 2 0.89 1.64 10 L 0 -5 -3 -5 -4 -3 -5 -5 -5 1 3 -5 0 3 -5 -3 3 -4 -2 3 8 0 1 0 0 1 0 0 0 8 27 0 2 13 0 1 20 0 1 16 0.60 1.59 11 G -1 -3 2 -4 -5 -4 -4 7 -3 -6 -6 -2 -5 -6 -3 -2 -3 -5 -3 -6 3 2 10 0 0 0 1 74 1 0 0 2 0 0 1 2 1 0 1 0 1.52 1.62 12 K -1 -1 -2 -4 -3 2 -3 -1 1 2 1 4 4 0 -4 -3 -1 -6 -3 -2 5 2 2 1 1 8 1 4 4 11 13 26 8 5 1 2 3 0 1 3 0.39 1.73 13 A 3 -5 -2 -4 -4 -4 -3 2 -3 1 -3 -4 0 -5 -5 2 3 -6 -5 3 23 0 1 1 0 0 2 13 1 7 2 0 2 0 0 16 15 0 0 17 0.52 1.72 14 D -2 -4 -1 4 -6 0 5 -4 -4 -4 -3 2 0 -6 1 0 -2 -7 -4 -1 3 0 2 20 0 4 31 1 0 1 2 13 2 0 8 6 2 0 1 6 0.65 1.76 15 E -2 3 -1 -3 -6 2 3 -3 0 -2 -4 4 0 -4 -2 -3 -1 -6 -2 -2 2 16 2 1 0 9 19 2 2 2 2 26 3 1 2 1 4 0 2 4 0.59 1.79 16 T -2 -3 -3 -5 -3 -3 -3 -4 -3 -1 -3 -4 -2 -1 -2 2 7 -3 -2 -1 1 1 1 0 0 1 2 1 1 4 2 0 1 3 2 12 63 0 1 4 1.12 1.79 17 K -1 1 -1 0 -3 0 1 -4 0 1 -3 4 -1 -4 -4 -1 0 -6 -5 3 6 6 3 5 0 3 7 1 2 7 2 28 1 0 0 5 5 0 0 17 0.40 1.79 18 D -5 -5 0 8 -7 -2 0 -3 -4 -7 -7 -1 -6 -7 -5 -3 -4 -7 -6 -6 0 0 4 86 0 1 3 1 0 0 0 3 0 0 0 1 0 0 0 0 2.11 1.78 19 E 0 1 -2 0 -3 0 4 -4 -3 -2 -4 2 -3 -6 3 0 0 -6 -5 -1 9 8 2 5 0 4 25 1 1 2 1 13 1 0 12 6 5 0 0 6 0.45 1.86 20 Q 0 -1 -2 2 -6 4 4 -4 -1 0 -3 -2 -2 -4 -5 -3 0 -6 -5 1 7 4 2 10 0 17 30 1 1 6 3 1 1 1 0 1 6 0 0 11 0.56 1.82 21 F -5 -6 -6 -6 -5 -6 -6 -6 -1 -1 -2 -6 0 8 -6 -5 -4 1 5 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 3 2 0 2 58 0 0 1 1 19 3 1.62 1.82 22 E -1 -3 1 5 -6 -1 5 -4 0 -2 -5 0 -2 -6 -5 -2 -2 -6 -5 -4 5 1 7 30 0 2 31 1 2 3 1 5 1 0 0 2 2 0 0 1 0.79 1.92 23 E -2 1 -1 3 -3 3 3 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -5 0 -1 -5 1 -2 4 7 3 16 1 12 19 2 1 2 3 4 1 2 0 6 4 0 5 4 0.30 1.92 24 Y 0 -3 -3 -3 3 -1 3 -2 2 -2 3 -3 0 -1 -4 -1 -2 0 1 -2 9 1 1 1 6 3 20 3 4 2 24 1 2 2 1 4 3 1 5 2 0.28 1.92 25 V 0 -3 -1 0 -1 -2 4 -4 0 -1 -1 0 -4 -1 -5 -1 -2 1 1 1 9 1 2 6 1 1 27 1 3 3 6 5 0 2 0 5 2 2 5 12 0.27 1.90 26 Q 0 3 0 -2 -6 3 2 -2 1 -3 -4 3 -2 -2 -5 -1 -1 -6 0 -3 9 15 5 2 0 14 13 3 3 2 1 14 1 2 0 5 3 0 3 1 0.35 1.90 27 N -3 4 4 1 -2 1 -1 -3 -1 -3 -1 4 -2 -3 -5 -2 -3 -6 -5 -3 1 21 16 7 1 6 3 2 1 1 7 20 1 1 0 3 1 0 0 2 0.51 1.89 28 F -3 -6 -6 -7 -6 -6 -6 -2 -5 -1 1 -6 0 8 -7 -3 -3 -3 3 -1 2 0 0 0 0 0 0 3 0 3 12 0 2 54 0 2 2 0 8 5 1.28 1.89 29 K -1 2 2 0 -1 2 1 -1 2 -2 -3 2 -1 -1 -5 -1 -1 -5 0 -3 4 12 10 4 1 9 7 6 4 3 3 12 2 3 0 4 4 0 3 2 0.19 2.01 30 R -1 0 -1 1 1 0 2 -2 0 -2 -3 1 1 -1 -5 1 1 3 -1 -1 6 5 3 8 3 4 11 4 2 3 3 9 3 2 0 9 8 4 2 5 0.09 1.98 31 Q -1 -1 -1 -5 -5 4 -1 -2 2 0 1 -1 2 0 -5 -1 0 -5 0 1 4 3 4 0 0 16 4 3 5 5 15 3 5 4 0 4 6 0 3 9 0.19 1.90 32 E -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0 5 5 0.05 2.01 33 A 0 1 0 0 -5 1 1 -2 1 -1 -1 3 1 0 -5 0 1 -5 -4 -1 6 7 4 5 0 6 7 3 3 4 6 15 4 5 0 7 7 0 0 5 0.10 1.90 34 E -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0 5 5 0.05 2.01 35 G 0 -2 -5 -4 1 -5 -5 2 -5 2 1 -3 1 -2 -5 -1 2 -5 -2 3 8 2 0 1 3 0 0 13 0 10 11 1 4 2 0 4 12 0 1 19 0.27 1.94 36 T -2 2 1 -2 -4 2 1 -2 1 -2 -3 3 -3 -3 -3 -1 2 -1 -4 -2 2 10 6 2 0 9 9 3 3 3 3 20 1 1 1 4 11 1 0 3 0.25 1.99 37 R -1 3 1 -2 -3 2 1 -3 0 -3 -2 4 -1 -3 -4 -1 -1 1 -5 -2 5 12 7 2 1 8 8 2 2 2 5 22 2 1 1 5 4 2 0 3 0.25 1.96 38 L -3 -5 -6 -3 0 -3 -5 -6 -5 2 5 -5 2 3 -3 -4 -3 -4 -1 0 2 0 0 1 2 1 0 0 0 10 46 0 4 12 1 1 2 0 2 6 0.69 1.88 39 Q -1 -1 -3 -2 -1 3 -1 -4 3 1 0 0 1 -1 -3 0 -2 -5 1 0 6 4 1 3 1 14 4 1 6 7 10 6 4 3 1 7 2 0 5 8 0.10 1.88 40 R -2 3 0 -1 -5 0 -1 -4 -2 -2 -3 5 -3 -2 -3 -2 -1 -5 -3 -2 2 16 4 4 0 3 4 1 1 3 2 37 1 2 1 2 3 0 1 3 0.54 1.87 41 E -1 -2 3 5 2 -1 3 -3 -2 -5 -6 -2 -2 -3 -5 0 -2 -6 -1 -3 5 2 13 26 5 2 20 2 1 0 0 1 1 1 0 6 2 0 2 2 0.55 1.90 42 L 0 -3 -3 -6 1 -5 -5 -3 -5 2 2 -5 2 1 -5 1 0 -5 -4 3 8 1 1 0 3 0 0 3 0 11 20 0 6 5 0 10 5 0 0 22 0.40 1.93 43 R 0 1 0 -2 -1 2 1 -2 1 -3 -3 5 -2 -6 -3 0 -1 -6 -5 -3 7 7 4 2 1 8 9 3 3 2 2 31 1 0 1 7 3 0 0 2 0.43 1.92 44 G 1 1 2 -2 1 1 -1 0 2 -2 -1 2 -1 -3 -5 0 -1 0 -3 -1 13 6 10 2 3 5 3 7 4 2 6 13 2 1 0 7 3 1 1 4 0.12 1.91 45 Y -3 -3 -3 -6 2 -3 -4 -4 0 -2 -1 -5 0 4 -6 -1 -4 5 8 -3 2 1 1 0 4 1 1 2 2 3 5 0 2 12 0 4 0 6 45 2 1.14 1.91 46 L -2 0 -2 -3 1 -1 -2 -3 0 2 2 -2 2 1 -2 0 0 1 0 1 3 5 2 2 3 3 3 3 2 9 20 2 4 5 2 7 6 2 3 9 0.11 2.07 47 A -1 0 0 3 -5 2 1 -2 1 -1 -1 0 1 -1 -5 0 0 -5 0 -2 4 6 4 15 0 8 10 4 3 3 6 6 3 3 0 8 6 0 3 3 0.14 2.02 48 A 3 0 0 -1 5 -1 -2 -2 3 -2 -2 -2 -4 -1 -1 1 -1 2 0 -2 20 6 5 4 10 3 3 3 7 3 3 3 0 3 3 8 3 2 4 3 0.22 2.00 49 I -2 -5 -1 -1 1 0 -5 -2 1 2 1 0 4 0 -5 -2 0 5 0 2 4 0 3 3 3 4 0 4 3 9 13 6 10 4 0 4 5 8 3 14 0.31 1.87 50 K 0 2 1 -1 3 1 -1 -2 3 -1 -1 2 1 -5 -1 -1 0 -5 0 -1 7 9 6 3 6 6 4 3 7 4 8 12 4 0 4 5 5 0 3 4 0.16 1.83 51 G 3 -1 0 1 -5 0 3 0 2 -2 -1 0 -1 -3 -5 -1 -1 -6 -5 1 19 3 5 8 0 3 16 8 4 3 6 5 1 1 0 5 4 0 0 9 0.25 2.01 52 M -1 -3 -2 -6 -1 -3 -2 -4 -1 1 2 -5 7 3 -4 0 -1 -1 -1 0 5 1 2 0 1 1 3 1 2 7 17 0 23 13 1 8 4 1 2 7 0.57 2.03 53 Q 1 -1 -1 -3 -1 1 -3 -4 3 0 3 -3 0 2 -4 0 1 -5 -1 0 10 3 3 2 1 6 2 1 6 4 25 2 2 7 1 6 9 0 2 8 0.25 2.04 54 E 0 0 1 1 0 2 2 -4 1 -1 -1 0 -1 -2 -2 2 2 -6 -3 -2 7 4 6 7 2 8 13 1 3 3 6 5 2 2 2 12 12 0 1 2 0.19 2.03 55 A 3 -1 1 -2 2 -1 -3 -2 4 -2 -3 -3 -1 -1 -5 3 0 0 -1 1 20 3 6 2 4 3 2 3 9 2 3 2 2 2 0 19 5 2 2 11 0.34 1.98 56 S -1 -2 -1 -2 1 5 0 -1 0 -1 -2 0 2 1 -1 2 -1 -5 -1 -2 5 1 2 2 3 26 4 6 2 3 3 5 5 5 3 14 4 0 2 2 0.38 2.02 57 M -1 -1 0 -2 1 1 0 -3 -1 2 -1 2 0 0 0 -1 0 -1 -2 2 6 3 4 2 3 5 7 2 2 10 7 11 3 5 4 5 6 1 2 12 0.07 2.04 58 K -1 4 1 0 0 2 1 0 -1 -3 -1 0 -1 -2 -2 1 -1 0 -5 -1 5 19 6 5 2 7 7 7 1 2 7 5 1 2 2 9 4 1 0 4 0.17 2.06 59 L -1 -3 -2 -3 -1 -5 -3 -6 -2 2 3 -5 2 4 0 -3 -2 -5 0 1 6 1 3 2 1 0 2 0 1 9 26 0 5 18 5 2 3 0 3 10 0.45 2.09 60 T -1 0 0 0 3 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 61 E -2 -1 0 1 1 1 4 -2 1 -2 -2 0 1 -5 0 -1 0 -6 0 -1 4 3 5 8 3 7 21 4 3 3 4 5 3 0 5 5 5 0 3 4 0.18 2.14 62 S 0 -1 -1 0 3 -1 0 -2 3 -1 -3 0 0 -1 -1 2 1 2 -1 -2 9 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