JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_4fKl5NJ.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|7|7|3|4|7|7|6|1|5|7|7|8|7|7|7|5|0|3|8|9|9|9|9|9|9|8|7|0|3|5|5|5|0|0|5|6|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|6|6|6|7|6|3|2|6|7|8|8|7|7|6|2|7|8|9|9|9|8|8|7|5|2|3|7|3|7|8|8|1|4|7|8|8|7|6|4|2|0|1|2|2|2|2|1|1|2|0|1|4|7|7|7|7|7|7|5|4|5|6|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|5|3|6|8|8|6|1|5|7|7|7|7|3|1|3|6|2|0|1|3|9|9|9|9|9|9|9|9|3|2|1|0|0|2|5|9|1|3|8|9|9|8|6|0|5|7|6|2|1|2|5|6|5|4|4|3|2|7|8|9|9|9|9|9|8|7|5|1|7|8|8|7|7|3|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|1|3|6|8|8|5|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|7|5|1|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|8|8|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|-|B|-|B|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|B|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|B|B|B|-|-|B|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles ||||||||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E||||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||E|E|E|E|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles ||||||||||E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*|*| | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | |*| | | | | | | |*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*|*|*| | |*|*|*| | | | | | | | |*|*|*|*|*|*| | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | 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