Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -4 -2 -3 2 -7 3 6 -5 -3 -6 -6 3 -5 -6 -4 -3 -4 -6 -5 -6 0 0 0 11 0 11 58 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0 0 0 0 1.37 1.46 2 R -2 3 0 -4 -4 5 0 -2 1 -5 -4 5 -2 -6 -3 -2 -1 -6 -4 -5 2 15 5 0 0 24 5 3 4 0 1 32 1 0 1 2 4 0 0 0 0.85 1.66 3 M -2 -3 -1 0 -4 -1 0 -1 -3 -2 -2 -1 9 -3 -1 -2 -1 -3 -2 -2 3 1 3 5 0 2 6 5 1 1 1 4 56 0 3 3 4 0 1 1 1.25 1.84 4 D -2 -4 4 6 -5 -3 3 -3 -3 -5 -6 -2 -5 -7 -2 1 -1 -7 -5 -5 4 1 17 39 0 0 15 2 0 1 0 2 0 0 2 12 4 0 0 1 0.99 1.98 5 C -3 -5 -1 -5 11 -6 -6 -5 -4 -5 -5 -5 -2 -5 -6 -1 2 -3 -6 -4 1 1 3 1 76 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 4 11 0 0 0 2.68 2.06 6 I -3 -4 -6 -5 -4 -5 -4 -7 -4 5 1 -3 -2 0 4 -5 -3 -6 -3 3 2 1 0 0 0 0 1 0 0 35 13 1 0 3 21 1 1 0 1 19 0.99 2.09 7 F -5 -6 -7 -6 -4 -5 -7 -4 -5 -2 -1 -7 -2 9 -7 -5 -4 -3 1 -4 0 0 0 0 0 0 0 2 0 2 4 0 1 86 0 0 1 0 2 1 2.37 2.09 8 C -1 -5 -5 -3 11 -4 -4 -2 -4 -4 -4 -5 -4 -5 -5 -1 -1 -4 -5 -4 4 1 0 2 75 1 1 3 0 0 1 0 0 0 0 6 4 0 0 0 2.57 2.12 9 K -1 3 1 1 -3 1 1 -2 1 -5 -4 5 -3 -5 -3 -1 -1 -6 -4 -4 6 14 6 8 1 6 9 2 3 0 2 31 1 0 1 4 3 0 1 1 0.59 2.04 10 I -2 -4 -4 -4 -3 -3 -4 -5 -3 7 1 -2 0 1 -2 -4 -3 -3 -2 0 4 1 1 1 1 1 1 1 1 59 9 3 2 4 3 1 1 0 2 4 1.09 1.99 11 A 2 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -4 -2 4 1 -3 -2 -3 1 -1 -2 -1 -3 3 18 1 1 3 1 1 1 1 1 23 11 2 1 1 8 4 3 1 1 19 0.47 2.02 12 N 2 3 3 1 -3 0 0 -2 0 -5 -4 1 -4 -4 -2 1 -1 -3 -2 -4 17 15 15 9 0 4 6 2 2 1 1 8 0 0 2 8 3 0 2 1 0.38 2.03 13 G -2 2 0 -1 -4 -1 -1 5 0 -4 -4 2 -2 -2 -2 -1 -2 0 -3 -4 3 9 5 4 0 3 4 39 2 1 2 13 1 2 2 4 2 1 1 1 0.58 2.00 14 E -3 -1 0 4 -4 1 5 -4 0 -4 -4 1 -4 -4 -3 -1 -1 -2 -3 -4 2 3 3 18 0 4 39 1 2 1 2 7 0 1 1 5 4 1 1 1 0.74 2.00 15 I -1 -1 -2 -1 -3 -2 1 -4 -3 5 1 -2 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -3 1 6 3 2 4 0 2 10 1 1 34 11 3 1 2 2 3 4 1 1 9 0.45 1.99 16 P -1 -2 -1 0 -3 -1 1 -2 -2 -3 -4 0 -5 -4 7 -1 -1 -3 -4 -4 4 2 3 5 0 3 9 3 1 2 1 5 0 1 50 4 4 0 1 1 1.08 1.94 17 S 3 -2 0 0 3 -1 -1 1 -1 -3 -3 -2 -4 -3 -3 3 0 -5 -3 -2 25 3 4 4 6 3 4 9 2 1 2 2 0 1 1 22 6 0 1 3 0.38 1.96 18 T -2 2 0 1 -2 1 1 -2 3 -2 0 1 -1 0 -2 -1 1 -1 2 -2 3 11 5 8 1 5 7 3 6 2 9 8 1 4 2 5 9 1 6 2 0.15 1.97 19 K -3 -1 -4 -4 -2 -2 -3 -4 -3 4 0 2 0 1 -2 -3 0 -1 -2 3 2 4 1 1 1 2 2 1 1 26 9 14 2 6 2 2 6 1 1 17 0.46 1.95 20 V -3 -3 -6 -4 -2 -4 -4 -5 -2 4 2 -4 -1 1 -4 -4 -3 -5 -2 5 2 2 0 1 1 1 1 1 1 21 20 1 1 5 1 1 1 0 1 40 0.89 2.00 21 Y 0 -2 -4 -2 -1 -3 -3 -4 3 -2 0 -3 -2 4 -6 -3 -3 5 7 -2 9 2 1 3 1 1 1 1 7 2 9 2 1 13 0 1 1 6 35 2 0.93 2.01 22 E -2 3 -1 -1 -2 2 6 -3 -1 -5 -4 0 -3 -4 -5 -1 -2 -6 -3 -4 2 15 2 3 1 7 49 2 1 1 1 5 1 1 0 5 2 0 1 1 0.94 2.01 23 D -3 -3 4 6 -3 -3 -2 1 -2 -5 -5 -3 -6 -4 -3 1 2 -2 -4 -5 1 1 18 41 1 1 2 9 1 1 1 1 0 1 1 9 11 1 1 1 0.93 2.02 24 D -1 0 0 5 -2 0 4 -2 -1 -4 -5 0 -3 -6 -1 -1 -2 -6 -3 -4 5 4 4 32 1 4 29 3 1 1 1 5 1 0 3 3 2 0 1 1 0.78 1.98 25 R -2 1 0 1 -2 1 0 -3 4 -1 1 1 -1 0 -4 -1 0 0 2 -2 2 6 5 8 1 6 6 2 10 3 14 10 1 3 1 5 5 1 6 3 0.20 2.00 26 V 1 -3 -2 -4 6 -5 -4 -3 -1 1 -1 -3 -1 3 -3 -1 0 1 1 3 13 1 2 1 14 0 1 2 1 6 4 1 2 11 1 6 5 2 4 23 0.49 1.93 27 L -2 -1 -3 -5 0 -2 -3 -3 -1 2 1 -2 1 3 -5 -2 -1 1 4 3 3 4 2 0 2 2 2 2 2 9 15 3 4 12 0 3 4 2 13 17 0.41 1.89 28 A 4 -2 -5 -2 3 -4 -4 -2 0 1 -1 -4 0 -1 -2 -1 -1 1 -1 3 36 3 0 2 5 0 0 3 2 8 4 0 2 3 2 3 3 2 3 18 0.50 1.86 29 F -2 -1 -5 -2 1 -1 -5 -2 1 2 0 -2 1 6 -5 -2 -1 3 1 0 3 4 0 3 3 3 0 3 3 12 7 3 4 32 0 3 3 3 4 5 0.60 1.96 30 N -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 31 D -1 -2 2 6 0 -2 -2 -2 0 -3 -4 -3 -2 -6 1 -1 -1 -6 -3 -2 6 2 10 47 2 1 2 2 2 1 2 1 1 0 7 4 5 0 1 4 0.90 2.11 32 L -1 0 0 -1 -1 -2 -2 -3 1 5 1 0 -1 -1 -2 -1 -1 2 -1 0 4 5 5 4 2 1 3 3 3 30 12 6 1 2 3 4 4 2 2 5 0.33 2.16 33 N 0 2 2 1 0 0 1 -1 2 -3 -3 0 1 1 -2 0 -2 2 1 -3 8 9 11 7 2 4 9 4 4 2 3 6 3 6 2 6 2 2 5 2 0.18 2.13 34 P -2 -2 -1 -2 1 0 -2 -1 0 -2 -3 -2 0 -1 6 -2 -2 2 -1 -2 4 3 3 3 3 5 3 4 3 3 3 3 3 3 43 3 3 3 3 3 0.82 2.14 35 V -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 36 A -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 5 5 0.13 2.01 37 P -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 38 Y -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 39 H -1 0 1 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 -5 0 0 -5 1 0 6 6 5 6 5 5 6 6 5 6 6 6 5 5 0 6 6 0 5 6 0.11 1.89 40 I 0 -1 -1 -2 3 -1 -4 -2 0 1 0 -2 1 0 -1 -1 1 2 1 3 9 3 3 3 5 3 0 3 3 9 7 3 4 4 3 5 9 3 5 19 0.20 2.01 41 L -1 0 0 0 3 1 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 -4 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 5 0.13 2.01 42 V -2 -2 -5 -5 0 -2 -5 -2 -5 4 0 -5 1 0 -5 -3 -2 -5 -1 5 3 3 0 0 2 2 0 3 0 22 9 0 3 4 0 2 2 0 3 40 0.75 1.70 43 V -1 -5 -2 0 2 -4 -2 -3 -5 4 0 -2 0 -1 1 -1 0 2 -1 3 5 0 2 5 5 0 2 2 0 26 8 2 2 2 6 4 5 3 2 17 0.40 1.80 44 P -2 -5 -5 -5 0 -4 -2 -2 0 -1 -2 -2 -4 0 7 -1 0 3 -1 -1 3 0 0 0 2 0 3 3 2 3 5 3 0 4 50 4 7 3 2 4 1.09 1.84 45 K -2 2 0 -2 -1 -1 0 -2 0 -2 -2 5 -1 -2 -2 -2 -2 3 2 -2 2 10 5 2 2 2 7 3 2 3 3 36 2 2 2 2 2 3 6 3 0.51 1.84 46 K 0 5 -1 -1 -1 1 1 -2 1 -3 -2 2 -1 -1 -1 -2 0 0 -2 -2 7 30 2 3 1 5 8 3 3 2 4 11 1 3 3 3 5 1 1 3 0.42 1.92 47 H -1 0 -1 -1 1 -1 0 -2 8 -2 -3 -1 0 -1 1 -1 -2 2 0 -2 4 5 3 3 3 3 5 3 34 3 3 4 3 3 7 4 3 3 3 3 0.72 2.11 48 Y -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.09 2.12 49 D -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 50 S -2 1 2 2 1 0 0 -1 1 -2 -2 0 0 1 -2 1 0 2 0 -2 3 6 9 11 3 4 5 5 4 3 4 5 3 5 3 11 7 3 4 3 0.13 2.18 51 L -1 -3 -2 -1 1 -2 -2 -3 0 2 3 -3 2 2 -2 -2 -2 3 1 1 4 2 3 3 3 2 2 2 2 13 23 2 4 8 3 3 3 4 5 7 0.27 2.21 52 I -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 53 D -1 -1 0 5 -1 0 2 -2 1 -2 -1 -1 -1 1 -2 -1 -1 -5 -2 -2 5 3 3 26 1 4 13 3 3 2 6 3 2 6 2 5 3 0 2 3 0.33 2.18 54 I 1 -3 -2 0 1 -2 -1 -3 -1 1 3 -3 2 0 -3 -2 -1 0 -1 0 10 2 2 5 2 2 4 2 1 7 29 2 4 3 1 3 4 1 2 7 0.20 2.22 55 P -1 0 0 0 2 0 0 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 -5 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0 5 5 0.02 2.12 56 D 0 -1 0 2 1 1 1 -2 1 -2 -3 0 0 -1 2 0 -1 2 -1 -2 7 4 4 10 2 5 11 4 3 3 3 5 2 3 12 6 4 2 2 4 0.09 2.17 57 K -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 58 E -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 59 M -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 60 D -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 61 I -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 62 V -1 0 0 0 2 0 -1 -1 2 0 -1 0 2 1 0 -1 0 4 1 -1 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 0.04 2.23 63 S 0 -1 -1 -2 1 0 -2 0 1 0 0 -2 2 2 -2 -1 -1 3 1 0 9 4 3 3 2 4 3 9 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