Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 K -3 0 -2 -1 -6 4 6 -4 -2 -5 -5 4 -4 -6 -3 -2 -3 -5 -4 -5 0 3 0 0 0 18 52 0 0 0 0 27 0 0 0 0 0 0 0 0 1.16 0.93 2 L -4 0 -6 -6 -4 -4 -5 -6 -5 1 5 -4 4 -2 -5 -5 -4 -4 -2 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 7 72 0 12 1 0 0 0 0 1 3 1.17 1.13 3 Q -2 2 4 -2 -5 4 0 -2 -2 -1 0 3 0 -5 -3 -1 -1 -5 -4 -3 2 10 21 1 0 19 5 2 1 3 10 17 2 0 0 2 3 0 0 1 0.49 1.15 4 V -3 -5 -6 -6 -3 -5 -5 -6 -6 5 -1 -5 -2 -3 -5 -5 -3 -5 -4 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68 1.46 1.18 5 E 1 1 0 2 -5 0 3 0 -2 -5 -4 1 -4 -4 -2 2 1 -6 -5 -4 12 6 3 10 0 3 17 8 0 0 1 9 0 0 2 19 10 0 0 0 0.39 1.18 6 A 4 0 -2 -4 -4 -1 -1 0 -4 -5 -5 3 -4 -5 3 2 -1 -6 -5 -3 35 3 1 0 0 2 3 6 0 0 0 19 0 0 15 12 2 0 0 1 0.63 1.18 7 I -4 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 7 2 -5 -1 -3 -5 -5 -3 -5 -4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80 16 0 0 0 0 0 0 0 0 4 1.56 1.18 8 K -3 3 1 -1 0 2 3 -4 1 -5 -5 4 -3 -3 -3 -1 -2 -5 -3 -4 1 14 6 3 2 9 22 0 4 0 0 30 0 1 1 4 2 0 0 1 0.67 1.18 9 R -3 -1 7 3 0 0 2 -3 1 -5 -6 0 -3 -6 -4 -1 -2 -2 -4 -5 1 3 51 13 2 3 12 1 3 1 0 6 0 0 0 3 1 1 0 0 1.03 1.18 10 G -2 -5 -3 -4 -5 -4 -5 7 -5 -7 -6 -4 -5 -6 -5 -3 -4 -5 -6 -6 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.19 1.18 11 T -3 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -5 -5 4 -1 -4 -1 2 -4 -1 6 -5 -2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28 4 0 1 8 0 4 49 0 1 6 0.94 1.18 12 V -2 -5 -6 -6 -3 -5 -5 -6 -6 1 -2 -5 -1 -3 -5 -4 -2 -6 -4 7 2 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 1 0 0 0 1 0 0 94 1.62 1.18 13 I -4 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 7 2 -5 0 -2 -5 -5 -3 -5 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79 18 0 1 1 0 0 0 0 0 2 1.54 1.18 14 D -4 -4 -1 8 -6 -3 -1 -4 -4 -6 -6 -3 -6 -6 -4 -3 -4 -7 -6 -6 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.28 1.18 15 H -4 -3 -2 -4 -6 -2 -3 -5 11 -6 -6 -3 -4 -4 -5 -3 -4 -5 -1 -6 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.88 1.18 16 I -3 -6 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 8 0 -5 -1 -3 -5 -5 -3 -5 -4 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 91 3 0 0 0 0 0 0 0 0 6 1.73 1.18 17 P -1 -1 -2 -1 2 1 0 -4 -2 -5 -4 2 -3 -6 6 -1 0 -6 -5 -3 5 2 1 3 4 6 7 0 1 0 1 12 0 0 47 3 6 0 0 1 1.02 1.18 18 A 6 -2 -2 -3 -1 -3 -3 -1 -3 -4 -4 -1 -4 -5 1 1 -1 -5 -4 -2 65 2 1 1 1 0 1 3 1 0 0 3 0 0 7 9 3 0 0 2 0.90 1.18 19 Q -2 -3 0 -1 -3 0 0 6 0 -6 -6 -3 -3 -6 -5 -1 -2 -1 -4 -5 1 1 4 3 0 4 6 69 3 0 0 1 1 0 0 4 1 1 0 0 1.22 1.18 20 I -2 2 -1 0 -2 3 -1 -4 2 0 -1 4 1 -3 -4 -1 0 -5 -2 0 2 9 2 5 1 14 2 1 4 6 5 29 3 1 0 3 7 0 1 6 0.41 1.18 21 G 3 -3 -3 -4 -1 -4 -3 4 -4 -3 0 -4 -2 -5 -4 2 1 1 -4 -2 30 1 0 0 1 0 1 32 0 1 9 0 1 0 0 13 8 2 0 2 0.65 1.18 22 F -3 -3 -5 -2 -5 -3 -5 -6 -2 2 3 -4 5 4 1 -3 -3 0 1 0 2 1 0 3 0 1 0 0 1 10 29 1 14 19 7 2 1 1 5 4 0.68 1.55 23 K -2 1 1 0 -6 2 1 -3 1 -4 -3 5 -2 -6 -3 0 1 -6 -3 -3 3 6 7 5 0 10 9 1 3 1 2 34 1 0 1 7 8 0 1 1 0.56 1.55 24 L -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 6 1 -5 0 -3 -5 -5 -3 -5 -4 5 2 0 0 0 0 0 0 0 0 41 10 0 1 0 0 0 0 0 0 43 1.25 1.48 25 L -1 -2 -5 -3 -2 -4 -3 -6 -4 1 4 -5 1 2 -5 -3 -2 -3 5 1 5 2 0 1 1 0 1 0 0 8 38 0 4 7 0 1 2 0 19 10 0.71 1.55 26 S -1 3 3 0 -5 1 0 -3 3 -4 -4 4 -4 -3 -4 1 -2 -5 -2 -5 4 17 14 4 0 5 6 1 7 1 1 23 0 1 0 11 2 0 2 0 0.58 1.55 27 L -2 -2 -3 -3 -4 -1 -3 -4 0 4 4 -3 2 0 -5 -4 -3 0 2 0 3 3 1 2 0 3 1 1 2 26 33 1 4 3 0 1 1 1 7 5 0.59 1.57 28 F -3 -2 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 1 5 -5 1 4 -6 -5 -2 -4 -3 -2 2 2 0 0 0 0 0 0 0 6 64 0 3 19 0 0 2 0 0 0 1.18 1.57 29 K -2 1 2 0 -2 0 1 4 3 -6 -4 3 -5 -6 -5 -1 -4 -6 -5 -6 2 7 8 5 1 5 8 32 8 0 2 18 0 0 0 4 0 0 0 0 0.65 1.63 30 L -2 -3 -6 -6 -4 -5 -6 -4 -6 4 5 -3 2 -1 -3 -5 -3 -1 -4 1 2 1 0 0 0 0 0 1 0 19 56 1 5 2 1 0 1 1 0 6 0.99 1.60 31 T -2 0 1 4 -6 1 2 -1 2 -3 -1 -1 -1 -3 0 -1 1 -5 0 -3 2 5 5 24 0 7 11 5 6 1 7 3 1 1 4 4 8 0 4 2 0.34 1.61 32 E -1 0 2 2 -6 0 2 1 3 -6 -3 3 -5 -6 0 0 -1 -6 -1 -6 4 4 9 10 0 4 14 13 7 0 2 16 0 0 4 7 4 0 2 0 0.40 1.85 33 T 0 -1 0 -1 1 -1 -1 -1 3 -1 1 1 1 -1 -1 1 1 -5 0 -1 6 3 4 3 3 3 4 4 7 4 11 9 3 3 3 12 9 0 4 4 0.10 1.99 34 D -1 0 1 0 3 1 0 -1 2 -4 -1 0 2 1 0 0 0 -5 1 -1 6 6 5 6 5 5 6 6 5 0 6 6 5 5 6 6 6 0 5 6 0.11 1.89 35 Q -2 -1 1 0 5 2 2 1 0 -4 -4 -1 -2 -1 -4 2 2 -2 0 -3 3 3 6 5 10 8 12 10 2 1 2 4 1 3 0 14 11 1 4 1 0.30 1.59 36 R 0 3 -1 -4 0 1 -1 1 -3 -3 -3 -1 -1 -2 2 1 2 -6 -3 0 8 17 2 0 2 5 4 9 1 1 1 4 2 2 12 10 12 0 0 6 0.29 1.59 37 I -3 -5 -5 -1 -2 -5 -3 -4 -5 4 0 -5 -1 -3 -5 -1 -2 -5 -1 6 1 0 0 4 1 0 2 1 0 26 5 0 1 1 0 5 1 0 2 50 0.99 1.57 38 T 3 -4 -3 -4 -1 -4 -4 -1 -5 -3 -2 -4 -1 -4 -4 3 5 1 -3 0 22 0 1 0 1 0 0 4 0 1 3 0 2 1 0 22 36 2 1 7 0.76 1.59 39 I -4 -1 -5 -5 0 -5 -3 -6 1 5 2 -5 0 0 -5 -1 -2 -5 -4 3 0 3 0 0 2 0 2 0 4 39 18 0 2 3 0 6 2 0 0 17 0.77 1.48 40 G 1 -5 -4 -5 -4 -4 -5 5 -5 3 -1 -4 1 -4 -2 -2 -4 -5 -5 1 10 0 0 0 0 0 0 44 0 19 7 0 3 0 2 3 0 0 0 10 0.81 1.44 41 L -2 -1 1 -4 -2 1 -4 -4 -4 1 2 0 6 0 -4 -3 0 -4 0 1 3 3 7 0 1 7 0 1 0 7 20 7 19 4 0 1 7 0 4 8 0.42 1.38 42 N -4 -1 8 0 -5 -3 -3 -2 2 -1 -3 -3 -4 -4 -4 -1 -3 -5 1 -4 1 2 68 4 0 0 1 2 5 5 3 1 0 0 0 3 1 0 4 1 1.37 1.36 43 L 2 -4 0 -5 0 -4 -5 -5 -5 1 3 -2 -1 2 -5 -3 -1 -4 0 3 15 0 5 0 2 0 0 0 0 5 29 3 1 7 0 1 2 0 3 24 0.51 1.44 44 P -1 1 0 1 -3 -1 0 -1 1 -3 -3 2 -2 -4 5 1 -1 -5 -3 -3 4 7 4 9 1 2 5 4 3 1 2 12 1 1 29 9 3 0 1 2 0.53 1.43 45 S -2 -3 -2 -1 -4 -3 -3 -3 1 -5 -5 0 -4 -5 0 6 1 -5 -4 -4 0 0 0 3 0 0 0 0 4 0 1 5 0 0 4 74 6 0 0 0 1.27 1.57 46 G -1 0 1 0 -1 0 0 2 3 -5 -4 3 -4 -2 -2 1 -1 -5 -1 -3 5 5 7 6 1 4 5 16 7 0 1 20 0 2 1 11 4 0 2 2 0.34 1.61 47 E 0 3 1 -1 0 0 0 -1 -1 -3 -3 4 -1 -3 -4 0 -1 -5 -2 -3 8 17 6 4 2 4 5 5 1 2 2 29 1 1 0 6 3 0 1 2 0.44 1.57 48 M -4 1 0 -1 1 0 -1 1 2 0 1 -1 4 1 -5 -2 -1 -4 1 -1 0 7 5 3 3 4 4 12 6 4 16 3 12 5 0 3 4 0 6 3 0.24 1.78 49 G -1 -1 0 -1 -5 0 0 5 1 -2 -3 -1 -4 -1 -1 -1 -1 -5 -5 -2 4 3 5 4 0 3 6 39 3 3 3 5 0 3 3 5 4 0 0 3 0.45 1.80 50 R -1 2 0 -4 0 -1 -2 -2 1 -3 -1 4 0 1 -5 -1 0 1 -1 -3 4 12 4 0 2 2 1 3 4 2 5 26 2 5 0 5 5 2 2 1 0.24 1.50 51 K -3 -1 -3 -3 -5 -2 -2 -4 -3 -4 -4 7 -4 -5 -3 -3 -3 -5 -4 -4 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 81 0 0 0 1 1 0 0 1 1.44 1.37 52 D -1 -3 -2 6 -4 -3 -2 2 -3 -4 -4 -3 -4 -4 -3 0 -3 -4 -4 -4 5 1 0 51 0 0 1 18 0 1 1 1 0 0 1 6 1 0 0 1 0.88 1.17 53 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 7 2 -2 1 -1 -5 -5 -3 -5 -1 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61 17 2 3 2 0 0 0 0 2 8 1.16 1.32 54 I -3 -6 -6 -1 -4 -5 -5 -6 -6 7 1 -5 0 -3 -5 -5 -3 -5 -4 3 1 0 0 4 0 0 0 0 0 66 12 0 2 0 0 0 0 0 0 14 1.28 1.34 55 K -3 0 -3 -4 -5 -2 -2 -4 -3 -2 -4 7 -4 -1 -4 -1 -3 -5 -4 -5 0 2 0 0 0 0 0 0 0 2 1 84 0 4 0 3 0 0 0 0 1.50 1.32 56 I -4 -1 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 7 1 -5 0 -2 -3 -5 -2 -5 -4 3 0 4 0 0 0 0 0 0 0 61 7 0 1 1 2 0 1 0 0 19 1.17 1.32 57 E 0 -2 -2 2 -5 -1 6 -4 -3 -5 -5 0 -5 -5 1 0 -2 -3 -2 -4 7 1 1 8 0 1 57 0 0 0 0 6 0 0 7 5 1 0 2 1 0.95 1.32 58 N -3 -3 5 3 3 -2 -1 3 0 -1 -3 -3 -4 -4 -4 -2 -1 -5 -4 -3 1 1 26 16 6 1 3 25 2 5 3 1 0 1 0 2 3 0 0 2 0.62 1.28 59 T -2 3 0 2 -2 -2 0 -2 2 -2 -3 1 -2 -1 1 -2 0 0 -2 1 3 18 4 10 1 1 6 3 5 2 3 10 1 2 8 2 6 1 1 11 0.20 1.27 60 F -3 -3 -2 -2 -3 -2 2 -4 -1 2 0 -2 1 5 -2 -1 -2 -1 2 0 2 1 2 1 1 1 17 1 1 11 9 2 3 23 2 5 2 1 8 7 0.40 1.27 61 L -3 -2 -1 1 -1 -3 -3 -4 -4 1 4 -3 1 4 -1 -3 -2 -3 -1 0 2 2 3 8 1 1 2 1 0 8 40 1 3 16 3 1 2 0 1 5 0.51 1.15 62 S -1 -1 1 2 -1 -2 1 -2 -2 0 -3 -1 0 -2 -1 3 3 -4 -3 -2 4 3 6 13 1 1 8 2 1 6 2 4 3 2 3 21 17 0 1 2 0.30 1.17 63 E -2 0 0 4 -5 1 3 -3 -1 -3 -3 1 -1 -4 2 0 -2 -2 -5 -4 2 4 5 27 0 6 20 1 1 2 2 9 2 1 9 7 1 1 0 1 0.54 1.31 64 D -1 -1 -1 1 -5 -1 3 -3 -2 2 1 1 -2 -1 -2 -1 -1 -5 -1 0 5 3 3 8 0 2 22 1 1 11 16 8 0 2 2 4 3 0 2 5 0.24 1.30 65 Q -2 -1 2 5 -6 3 4 -4 -1 -3 -4 -2 -3 -6 -4 -1 -1 -6 -5 -4 2 3 10 31 0 12 32 0 1 2 1 1 1 0 0 2 3 0 0 1 0.90 1.33 66 V 2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -5 -5 3 4 -5 1 1 -5 -3 -2 -1 1 2 18 0 0 0 0 0 0 0 0 14 39 0 3 4 0 1 2 1 5 14 0.69 1.35 67 D -1 -2 5 5 -5 -1 0 -2 -2 -5 -5 1 -3 -6 -4 0 0 -6 -5 -5 5 1 29 34 0 2 5 2 1 0 0 8 1 0 0 7 6 0 0 0 0.89 1.32 68 Q -2 3 -3 -4 -4 2 -1 -5 -1 2 0 3 1 -2 -4 -3 -3 -5 -4 3 3 14 1 0 0 11 3 0 1 14 7 17 3 1 0 1 1 0 0 21 0.47 1.32 69 L -4 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -7 -6 4 5 -5 0 -3 -6 -5 -2 -5 -4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27 64 0 1 0 0 0 2 0 0 7 1.27 1.35 70 A 4 -3 -3 -4 -2 -4 -4 4 -4 -5 -5 -2 -4 -5 -4 3 -1 -6 -5 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