Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 E -4 -2 -2 5 -6 0 5 -4 -3 -6 -6 2 -5 -6 -4 -3 -3 -6 -5 -5 0 0 0 39 0 2 46 0 0 0 0 13 0 0 0 0 0 0 0 0 1.29 1.07 2 R -3 3 -2 -2 -5 2 4 -5 1 -2 -3 2 -1 -1 -4 -1 1 -5 -1 0 1 15 0 1 0 8 32 0 3 3 1 10 2 3 0 4 9 0 2 7 0.50 1.12 3 I -3 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 6 2 -5 -1 -3 -5 -5 -3 -5 -4 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 59 14 0 0 0 0 0 0 0 0 26 1.27 1.12 4 D -1 1 1 2 -3 -1 3 -2 1 -1 -4 1 -3 -4 -4 0 0 -5 -3 1 4 8 7 9 1 2 24 3 3 3 1 10 0 0 0 7 7 0 0 10 0.33 1.16 5 N -1 0 0 0 -5 -2 0 6 -1 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -1 -3 -5 -5 -5 4 6 4 6 0 1 6 66 1 0 0 1 0 0 0 4 0 0 0 0 1.16 1.13 6 V -3 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 6 1 -5 -1 0 -5 -4 -2 -5 -3 5 1 0 0 0 0 0 0 0 0 44 13 0 0 3 0 1 1 0 0 38 1.11 1.13 7 L -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 2 4 -5 0 4 -5 -5 -3 -4 -1 4 2 0 0 0 0 0 0 0 0 10 38 0 1 19 0 0 1 0 1 29 0.91 1.13 8 V -1 4 -1 -3 -2 -1 -1 -4 -1 0 -4 5 -3 -5 -3 1 1 -5 -4 -1 4 20 2 1 1 1 3 0 1 7 0 34 0 0 1 12 7 0 0 5 0.57 1.13 9 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.21 1.13 10 P -1 -4 2 -3 -5 -2 -3 -3 -4 -3 -5 -3 -1 -1 7 0 0 -6 -4 -3 5 0 10 1 0 1 1 2 0 2 0 1 2 4 60 6 7 0 0 1 1.38 1.13 11 N -4 -3 8 0 -5 -2 -3 -3 -2 -6 -6 -3 -5 -6 -5 -2 -2 -6 -5 -6 0 0 97 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.15 1.13 12 S -1 1 -1 -3 -5 -2 -2 -2 -1 -5 -3 -3 -3 -3 7 3 -1 -6 -4 -4 4 7 2 0 0 1 2 2 2 0 2 0 1 2 48 23 4 0 0 1 1.11 1.13 13 N -3 -1 7 0 -5 -1 -2 -1 -2 -5 -3 3 -3 -2 -4 0 -1 -6 -4 -3 1 2 53 3 0 1 1 4 0 0 2 21 1 3 0 5 3 0 0 1 0.99 1.13 14 C -3 -6 -5 -6 11 -6 -6 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -3 -5 -5 -3 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.21 1.13 15 I -1 -5 -6 -6 -4 -5 -6 -6 -6 7 -1 -5 -1 -3 -5 -4 -3 -5 -4 2 6 0 0 0 0 0 0 0 0 84 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10 1.56 1.13 16 S -2 -3 -2 -3 -1 -3 -3 -3 -4 -3 -4 -3 -3 -5 -3 4 6 -5 -4 -3 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 39 58 0 0 0 1.26 1.13 17 H -4 2 7 -1 -5 -1 -1 -3 6 -6 -5 -2 -4 -5 -5 -1 -2 -6 -3 -5 0 9 58 1 0 1 2 0 24 0 1 1 0 0 0 2 2 0 0 0 1.42 1.13 18 A -1 -2 6 -1 -2 -1 -2 2 4 -4 -5 -1 -2 -3 -4 2 -1 -5 0 -2 4 1 37 3 1 2 1 13 11 1 0 2 1 1 0 14 4 0 3 3 0.68 1.13 19 E -3 -3 -1 1 -6 0 7 -3 -1 -6 -6 -2 -5 -6 -4 -3 -3 -6 -5 -5 0 0 2 5 0 2 88 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.67 1.13 20 P -2 -1 0 -4 -6 -3 -2 -2 -2 -3 -2 0 -3 -3 8 -3 -4 -6 -1 -2 2 3 5 0 0 1 3 3 1 1 4 5 1 1 65 1 0 0 2 2 1.56 1.52 21 V -2 -5 -5 -5 -4 -4 0 -4 -5 4 -1 -2 6 -4 -5 -4 -2 -5 -4 5 3 0 0 0 0 0 6 1 0 21 1 3 18 0 0 0 2 0 0 44 1.01 1.50 22 S 1 0 0 1 -2 2 3 -3 -2 -2 -4 2 -4 -4 0 0 1 -6 -3 -2 13 4 3 6 1 8 20 1 1 2 1 13 0 1 4 6 10 0 1 3 0.34 1.52 23 S -1 -2 -2 -4 -4 -3 -4 -1 -4 -2 -3 -2 -4 -5 1 5 5 -6 -5 -4 3 1 1 0 0 0 0 4 0 2 3 1 0 0 6 46 33 0 0 0 0.96 1.52 24 S -2 4 -1 -1 -1 -1 -1 -2 1 0 -2 3 -2 -3 -5 2 -2 -1 0 -2 2 27 2 3 1 2 3 2 3 6 3 17 1 1 0 17 1 1 4 3 0.46 1.52 25 F -5 -6 -6 -6 -5 -3 -2 -6 -4 -2 -2 -6 1 9 -6 -5 -2 -2 1 -4 0 0 0 0 0 1 3 0 0 2 2 0 3 85 0 0 2 0 2 0 2.11 1.52 26 A -1 0 1 0 -2 -1 0 -4 6 1 -1 1 -2 1 -5 -1 0 -1 3 -2 5 5 5 5 1 2 5 1 17 8 5 10 1 7 0 5 7 1 8 2 0.34 1.51 27 V -2 -3 -2 -6 -4 -5 -5 -6 -6 2 0 -3 -1 -1 -5 -3 -1 -6 -4 6 1 1 2 0 0 0 0 0 0 10 6 2 1 2 0 2 4 0 0 69 1.20 1.52 28 R -3 1 -2 -3 -5 0 1 -5 -2 3 1 2 -1 -2 -5 -1 0 -5 -3 2 2 8 1 1 0 4 10 0 1 17 11 14 1 2 0 5 6 0 1 15 0.33 1.48 29 K -2 -2 2 3 -5 0 1 -2 0 -2 -2 1 -1 -2 -2 2 0 -5 -4 0 3 2 10 16 0 5 10 3 2 2 3 7 2 2 2 19 4 0 0 8 0.29 1.45 30 R -2 3 -1 2 -5 1 1 -2 0 -3 -4 5 -2 -4 -4 0 -1 -5 -3 -3 3 16 2 11 0 6 8 3 2 1 1 34 1 1 0 5 3 0 1 2 0.58 1.37 31 A 1 -1 2 0 -2 0 2 2 1 -2 -2 2 -3 -2 -2 1 -2 -4 -2 -2 10 2 9 5 1 3 12 15 4 2 3 14 0 2 1 11 1 0 1 3 0.24 1.19 32 N -2 0 3 2 -2 1 2 2 3 -3 -4 1 -2 -2 -2 -1 -1 -4 -3 -3 3 5 16 11 1 5 12 14 6 2 2 9 1 2 2 5 3 0 0 2 0.34 1.19 33 D -2 0 1 2 -1 1 2 1 -1 -4 -3 1 -4 -4 5 -2 -1 -5 -4 -3 2 4 6 10 2 7 11 12 1 0 3 8 0 1 26 2 4 0 0 1 0.51 1.27 34 I -2 -2 -4 -2 -1 -4 -3 -4 -4 4 2 -4 0 -1 -2 -3 1 -4 -3 4 2 2 0 2 1 0 1 2 0 28 17 1 2 2 2 1 8 0 0 29 0.64 1.26 35 A 0 2 0 -3 -1 1 -1 -2 2 0 -1 3 1 -1 -3 -2 1 -3 0 0 7 11 4 1 1 6 4 3 4 5 5 20 4 2 1 3 10 0 3 7 0.21 1.08 36 L -2 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -5 2 5 -5 2 0 -5 -5 -4 -4 0 2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 9 66 0 4 3 0 0 0 0 3 11 1.09 1.37 37 K -4 6 -2 -4 -1 2 -1 -5 -1 -4 -4 5 -4 -6 -4 -2 -1 -6 -4 -3 0 39 1 0 1 7 2 0 1 1 1 39 0 0 0 1 4 0 0 2 1.15 1.38 38 C -3 -6 -6 -7 12 -6 -7 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.44 1.39 39 K -1 1 -2 -1 -3 -1 -1 -4 8 -2 -3 3 -2 0 -5 -2 -3 -5 2 -1 4 7 1 3 1 1 3 1 34 3 2 21 1 3 0 3 1 0 7 5 0.84 1.39 40 Y -5 -5 -5 -6 -5 -4 -5 -6 1 -4 -4 -5 -4 1 -6 -5 -5 0 10 -4 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 2 0 0 0 0 96 0 2.65 1.39 41 C -3 -6 -6 -7 12 -6 -7 -5 -6 -4 -4 -6 -4 -5 -6 -4 -4 -5 -5 -4 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3.44 1.39 42 E -3 -2 0 2 -6 -1 7 1 -3 -6 -6 -2 -3 -6 -4 -2 -3 -6 -5 -5 1 1 3 7 0 0 74 9 0 0 0 1 1 0 0 2 1 0 0 0 1.41 1.37 43 K -3 5 -2 -3 -6 -1 -2 -5 -1 -4 -5 6 -2 -4 -4 -2 -1 -3 -3 -4 2 35 1 0 0 2 1 0 1 1 0 49 1 1 0 1 4 0 0 1 1.21 1.38 44 E -3 -1 -3 0 -5 -1 4 -4 -4 1 -2 0 -1 -3 -4 0 2 -5 -1 2 1 3 0 4 0 2 29 1 0 9 4 6 1 1 0 7 13 0 2 18 0.44 1.34 45 F -4 -5 -5 -6 -4 -1 -5 -6 -4 3 0 -5 3 6 -6 -5 -1 -3 1 1 0 0 0 0 0 4 0 0 0 20 8 0 9 41 0 0 4 0 4 10 1.04 1.30 46 S 0 -1 0 3 -5 0 2 -2 0 -3 -3 -1 -2 -5 -1 3 2 -6 -3 -3 6 2 4 14 0 4 13 3 3 2 3 2 1 0 2 28 11 0 1 1 0.42 1.32 47 H -2 5 0 0 -6 1 3 -3 4 -3 -4 3 -4 -5 -4 -2 -3 -2 -1 -4 2 30 4 4 0 6 17 2 10 2 1 17 0 0 0 1 1 1 3 0 0.72 1.31 48 N -2 -2 2 5 -6 2 4 -3 2 -6 -5 1 -5 -4 -4 -1 -2 -6 -3 -5 2 1 9 28 0 8 33 2 5 0 0 7 0 1 0 3 1 0 1 0 0.88 1.31 49 V 0 -4 -4 2 -5 0 4 -5 -1 4 -2 -3 -1 -2 -5 -2 -2 -5 -4 2 7 0 0 11 0 3 27 0 2 28 2 0 1 2 0 2 2 0 0 12 0.59 1.29 50 V -3 -5 -6 -6 -4 -5 -5 -6 -6 5 0 -3 3 0 -3 -5 -3 -5 -4 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30 5 1 7 3 1 0 0 0 0 53 1.15 1.23 51 L -2 -5 -5 -5 -4 -4 -3 -5 -5 4 3 -4 1 -3 -5 -3 3 -5 -4 2 3 0 0 0 0 0 2 0 0 29 29 0 3 0 0 1 20 0 0 13 0.75 1.14 52 A 1 2 1 -2 -5 1 4 -1 -3 -5 -4 2 -1 -3 -4 2 -3 -5 -4 -4 12 10 8 0 0 5 33 3 0 0 1 11 2 1 0 13 0 0 0 1 0.54 1.01 53 N -3 -2 8 3 -5 -2 -2 -2 3 -5 -5 -2 -4 -5 -4 -1 -2 -6 -4 -5 0 0 82 12 0 0 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.53 0.73 K Lambda Standard Ungapped 0.1298 0.3194 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1929 0.3145 PSI Gapped 0.0590 0.2670