JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_EhNNqlA.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet ||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||E|E||||||E|E|E|E||||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 8|9|8|8|7|7|7|7|7|7|7|7|6|6|6|7|7|7|7|7|4|1|3|9|9|8|5|5|8|6|4|8|9|9|9|8|1|3|6|7|7|7|7|6|5|4|6|1|2|5|8|9|9|7|0|7|7|0|7|8|9|8|4|4|7|8|6|3|6|6|8|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|2|7|8|8|6|3|7|8|8|7|4|4|7|7|8|8|7|7|5|2|7|8|8|8|7|6|2|4|7|8|8|7|6|3|2|8|9|9|9|9|8|7|5|1|6|7|8|7|7|6|3|3|1|2|5|6|7|7|7|7|7|7|7|6|5|0|2|0|3|4|5|0|2|2|1|0|1|6|5|3|5|7|7|7|3|5|8|9|8|5|4|8|8|4|6|8|8|5|3|1|0|1|7|7|6|6|6|5|5|6|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|5|8|8|6|3|6|7|5|0|5|7|8|8|7|6|3|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|8|5|1|8 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|B|-|B|-|B|-|B|B|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|B|B|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||||||||||||||||||||||E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E||||||||||||E|E|E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||E|E|||||E|E|E|E|E|E|||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E|E|E|E|E||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E||||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||||E|E|E|E|E|E|||E|E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||||||||||||||||E|E|E|E|E|||||E|E|E|E||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | |*|*|*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |