JALVIEW_ANNOTATION # Created by concise2jalview using 'jp_bjpp1Fc.concise' as input NO_GRAPH Lupas_21 Coiled-coil prediction windowed over 21 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_14 Coiled-coil prediction windowed over 14 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH Lupas_28 Coiled-coil prediction windowed over 28 residues -|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH jnetpred Final secondary structure prediction by Jnet |||E|E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|H|H|H|H|H|H|H||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||| BAR_GRAPH JNETCONF Confidence of Jnet prediction 0 (low) -> 9 (high) 9|9|2|6|8|9|9|8|8|1|3|7|7|7|7|7|7|7|0|2|2|3|6|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|2|5|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|4|6|7|7|7|7|7|7|6|5|3|1|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|5|1|7|8|8|4|5|8|8|6|1|5|7|7|7|8|0|1|2|4|6|6|5|5|4|1|6|8|8|8|4|5|7|8|7|4|3|6|7|7|7|7|6|6|7|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|7|8|9|9|9|9|8|7|5|1|5|7|7|7|7|7|7|7|6|5|2|0|1|4|6|7|7|7|7|7|4|1|5|6|4|2|1|7|7|6|4|2|2|3|6|7|7|7|5|0|6|8|8|0|2|3|0|6|7|7|8|7|4|2|3|3|7|8|9|9|9|9|9|9|9|8|7|2|4|8|8|8|6|1|6|8|8|7|4|0|7|7|7|6|4|0|3|3|2|0|4|6|7|8|8|7|7|7|7|5|2|7|8|9|9|9|9|9|9|9|9|8|6|0|7|9|6|0|8|9|9|9|8|8|8|5|4|7|8|8|8|6|4|1|8|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|9|8|2|1|5|7|8|8|8|8|9|9 NO_GRAPH JNETSOL25 Jnet solvent relative accessibility prediction at 25% cut-off -|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|-|-|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|B|-|B|-|B|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|B|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|B|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL5 Jnet solvent relative accessibility prediction at 5% cut-off -|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|B|-|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|B|B|B|-|B|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETSOL0 Jnet solvent relative accessibility prediction at 0% cut-off -|-|-|-|-|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|B|-|-|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|B|B|-|-|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|-|-|B|B|-|-|B|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|B|B|-|B|B|-|-|-|B|-|-|B|B|B|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|-|- NO_GRAPH JNETHMM Jnet prediction using HMMer profiles |||E|E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|E|E|||||H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E|E||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|E|E|E|E|E|E|||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||| NO_GRAPH JNETPSSM Jnet prediction using PSSM profiles |||E|E|E|E|E|E|E|||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||||||||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E||||||||||H|H|H|H|H|||||||E|E|E|E|E||||||||||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||||||||||||||||||||E|E|E|E|||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|||||E|E|H|H|H|H|H|H|H||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|||||||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||E|E|E|E|E|E|E|E|E||||||||H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H|H||||||||| NO_GRAPH JNETJURY Positions where Jnet predictions do not agree | | | | | | | | |*| | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | |*|*|*|*| | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*|*| | | | | | | | | | | | | | | | |*| | |*| | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | |*| | | | | | |*|*|*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |*| | | | | | | | |