Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 P 0 -3 -3 -2 -3 -2 -2 -2 -3 -3 -3 -1 -3 -4 8 -1 -1 -4 -3 -3 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89 0 0 0 0 0 1.88 0.13 2 I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -4 6 2 -4 1 -1 -4 -3 -1 -3 -2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.70 0.22 3 C -1 -4 -4 -5 10 -4 -5 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.89 0.25 4 T -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -3 1 -1 -2 -1 -3 -2 0 6 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14 0 0 0 0 0 0 86 0 0 0 0.71 0.25 5 N -2 -1 7 0 -3 -1 -1 -1 0 -4 -4 -1 -3 -4 -3 0 2 -5 -3 -3 0 0 84 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16 0 0 0 0.97 0.25 6 C -1 -4 -4 -5 10 -4 -5 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.89 0.25 7 C -1 -4 -4 -5 10 -4 -5 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.89 0.25 8 A 4 -2 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -3 -1 -2 -3 -2 3 1 -4 -3 -1 56 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35 9 0 0 0 0.55 0.25 9 G -1 -3 -1 -2 -3 -3 -3 7 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.41 0.25 10 Y -2 1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 0 -2 -1 1 0 3 -3 -1 2 0 6 -2 0 9 0 0 0 0 0 0 0 0 2 12 2 12 0 0 24 0 38 0 0.48 0.25 11 K -2 2 -1 -1 -4 1 1 -2 -1 -4 -3 6 -2 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0.87 0.25 12 G -1 -3 -1 -2 -4 -2 0 6 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 0 0 0 0 0 0 7 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.26 0.25 13 C -1 -4 -4 -5 10 -4 -5 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.89 0.25 14 N -2 0 6 0 -4 0 -1 -2 2 -4 -3 2 -1 -2 -3 0 -1 -3 2 -3 0 3 60 0 0 0 0 0 4 0 0 18 3 0 0 3 0 0 9 0 0.64 0.25 15 Y -3 -3 -3 -4 -3 -2 -3 -4 1 -2 -2 -3 -2 3 -4 -2 -1 2 8 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 4 0 93 0 1.28 0.25 16 Y -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 0 -1 -1 -3 -1 6 -4 -3 -1 1 6 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53 0 0 4 0 43 0 1.03 0.25 17 S 0 -2 2 0 -2 -1 -1 0 -1 -3 -4 -1 -2 -3 -2 5 0 -3 -1 -3 0 0 10 3 0 0 0 5 0 0 0 0 0 0 0 80 0 0 3 0 0.62 0.25 18 A 4 -1 -1 0 -2 1 0 -1 -2 -2 -3 1 -2 -3 -2 1 -1 -3 -1 -1 60 0 3 6 0 5 6 0 0 0 0 10 0 0 0 6 0 0 2 2 0.39 0.25 19 N -2 -2 5 5 -4 -1 1 -2 0 -2 -3 -1 -3 1 -3 -1 -1 -4 -2 -3 0 0 42 37 0 0 5 0 2 3 0 3 0 8 0 0 0 0 0 0 0.67 0.25 20 G -1 -3 -1 -2 -3 -3 -3 6 -2 -5 -4 -2 -3 -3 -3 -1 -2 -3 1 -4 0 0 0 0 0 0 0 93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7 0 1.25 0.25 21 A 0 0 -1 0 -2 -1 0 -2 -2 -2 -2 1 -2 -3 -2 0 5 -4 -3 -1 7 3 0 5 0 0 5 0 0 0 0 8 0 0 0 0 72 0 0 0 0.57 0.25 22 F -3 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -2 -1 1 -4 0 7 -5 -3 -3 0 3 -1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12 0 0 85 0 0 0 0 4 0 1.07 0.25 23 I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -4 6 1 -4 0 -1 -4 -3 -1 -4 -2 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23 0.73 0.25 24 C -1 -4 -4 -5 10 -4 -5 -3 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.89 0.25 25 E -2 -1 -1 2 -5 1 6 -3 -1 -4 -4 1 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 0 0 0 10 0 0 84 0 0 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0.96 0.25 26 G -1 -3 -1 -2 -3 -3 -3 7 -3 -5 -5 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -3 -4 -4 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.41 0.25 27 Q -1 0 -1 0 -4 4 5 -3 -1 -4 -4 1 -2 -4 -2 0 -1 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 24 67 0 0 0 0 2 0 0 0 4 3 0 0 0 0.82 0.25 28 S 0 -2 0 -1 -2 -1 -1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2 5 2 -4 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 6 0 0 0 0.76 0.25 29 D -2 -2 1 6 -4 -1 2 -2 0 -4 -4 0 -3 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -4 0 0 4 74 0 0 9 0 3 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0 0 0.94 0.24 30 P -2 -2 -1 -2 -3 -2 -2 -3 -3 -3 -3 0 -3 -3 8 -2 -2 5 -2 -3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 1 6 0 0 75 0 0 11 0 0 1.67 0.29 31 K -2 4 2 -1 -4 0 2 -3 -1 0 -3 3 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -3 0 0 35 10 0 0 0 15 0 0 8 0 25 0 0 0 0 0 0 0 7 0.48 0.31 32 K -2 1 5 0 -4 0 1 -2 2 -4 -4 3 -3 -4 -3 1 0 -4 -3 -3 0 5 44 3 0 0 6 0 4 0 0 21 0 0 0 11 6 0 0 0 0.57 0.31 33 P -2 0 1 -2 -4 -2 0 -2 -3 -4 -4 -1 -3 -5 8 -2 -2 -5 -4 -4 0 7 8 0 0 0 4 3 0 0 0 0 0 0 78 0 0 0 0 0 1.69 0.31 34 K -2 1 3 -1 -4 0 1 -2 -1 -4 -4 6 -3 -4 -2 -1 -1 -4 -3 -3 0 3 19 0 0 0 8 0 0 0 0 71 0 0 0 0 0 0 0 0 0.76 0.31 35 A 4 -1 -2 0 -2 -2 -2 1 1 -1 -2 -2 -2 -3 2 0 0 -4 -3 0 52 2 0 5 0 0 0 8 5 3 0 0 0 0 11 0 5 0 0 8 0.37 0.31 36 C -1 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.02 0.31 37 P -1 -3 -2 -2 -3 -2 -2 -3 0 -3 -3 -2 -3 -4 7 1 3 -4 -3 -3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 63 12 23 0 0 0 1.35 0.31 38 L -2 4 -2 -3 -4 2 -1 -3 -2 -2 1 3 -1 3 -3 -1 -2 -2 0 -2 0 27 0 0 0 9 0 0 0 0 21 21 0 16 0 3 0 0 3 0 0.37 0.31 39 N -2 -1 6 0 -4 0 3 -2 0 -4 -4 -1 -3 -1 -3 -1 -1 -4 1 -4 0 0 61 0 0 0 31 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 5 0 0.81 0.31 40 C -1 -5 -4 -5 11 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.02 0.31 41 D -3 -3 2 7 -5 -1 1 -2 -2 -4 -5 -2 -4 -5 -3 -1 -2 -5 -4 -4 0 0 8 92 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1.33 0.31 42 P -1 1 -2 -2 -3 -2 -2 1 0 -4 -4 -1 -3 -4 7 -1 1 -4 -3 -3 0 12 0 0 0 0 0 13 2 0 0 0 0 0 57 3 14 0 0 0 1.13 0.31 43 H -2 5 2 0 -4 2 -1 -3 4 -4 -4 2 -2 -4 -3 -1 -2 -4 -2 -4 0 53 10 5 0 8 0 0 13 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0.73 0.31 44 I -2 -4 -4 -4 -2 -4 -4 -5 -4 6 1 -4 0 -1 -4 -3 -2 -4 -2 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0.89 0.31 45 A 5 -2 -2 0 -2 -1 0 -1 -3 -2 -2 -2 -2 -2 -2 0 -1 -4 -3 -1 82 0 0 6 0 0 7 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 0 0 3 0.62 0.31 46 Y -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 1 -1 -2 -3 -2 4 -4 -3 -3 1 8 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 11 0 0 0 0 86 0 1.33 0.31 47 S 1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 3 -2 -3 -3 -1 1 -3 -2 4 0 -4 -3 -3 6 2 0 0 0 0 3 29 0 0 0 0 6 0 0 54 0 0 0 0 0.55 0.31 48 K -2 1 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -3 4 0 4 -1 -2 -3 -2 0 -4 -3 1 0 7 0 0 0 0 0 0 0 36 2 40 0 0 0 0 7 0 0 7 0.39 0.31 49 C -1 -5 -4 -5 10 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.00 0.30 50 P -2 -2 -3 -2 -4 -2 -2 -3 -3 -4 -4 -2 -3 -5 8 -1 -2 -5 -4 -3 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95 2 0 0 0 0 2.21 0.28 51 R -2 7 -1 -2 -4 0 -1 -3 3 -4 -3 2 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2 -3 0 89 0 0 0 0 0 0 11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.97 0.19 K Lambda Standard Ungapped 0.1403 0.3222 Standard Gapped 0.0410 0.2670 PSI Ungapped 0.1732 0.3151 PSI Gapped 0.0530 0.2670