Included Tools

Multiple Sequence Alignment

• Clustal Omega (version 1.2.4)
• ClustalW (version 2.1)
• Mafft (version 7.310)
• Muscle (version 3.8.31)
• T-coffee (version 11.00.8cbe486)
• Probcons (version 1.12)
• MSAProbs (version 0.9.7)
• GLProbs (version 0.9.7)

Protein Disorder Prediction

• DisEMBL (version 1.5)
• IUPred (version 1.0)
• Jronn - Java implementation of Ronn (version 3.1)
• GlobPlot (version 2.3)

Amino Acid Conservation

• AACon (version 1.1)

RNA Secondary Structure

• RNAalifold from ViennaRNA (version 2.0)